FISHBOX

En cours

Automate de terrain pour la quantification spécifique de micro-organismes

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Le projet FISHBOX automatisera la technique de biologie moléculaire TSA-FISH (Tyramide Signal Amplification-In Situ Hybridization) et sera couplé à un microscope à épifluorescence qui permettra une observation et une quantification des micro-organismes marqués spécifiquement par une sonde moléculaire fluorescente.

Le projet se déroulera en 3 phases :

-          Phase 1 : Spécifications fonctionnelles et architecture du système. Le consortium intègre un comité d’utilisateurs du monde industriel et du monde de la recherche, chargés de missions d’analyse pour le compte de l’état, des collectivités ou de sociétés privés (eaux de mer, eaux douces, air) qui permettra de concevoir un système répondant aux attentes du terrain.

-          Phase 2 : Cette phase se découpe en 2 axes parallèles :

  • Développement et intégration de la valise automatique FISHBOX
  • Développement de sondes moléculaires FISH répondant aux besoins du comité des utilisateurs

-          Phase 3 : Essais et validation sur une période de 12 mois (minimum) de la valise FISHBOX sur les réseaux et stations de mesure animés comité des utilisateurs auquel s’ajoutera le réseau REPHY de Ifremer (partenaire sous-traitant du consortium)

En fin de phase 3, le consortium organisera un workshop afin de présenter les résultats obtenus dans la durée ; de même, les partenaires du monde de la recherche publieront les résultats de leurs travaux de mise au point de nouvelles sondes moléculaires spécifiques.

 

Retombées et perspectives 

Confortée par  une étude de marché,  industrialisation des prototypes .

 

Porteur du projet
CHRISAR Software Technologies
Partenaires industriels
VEOLIA, MERMEC
Partenaires recherche
IRD, Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris, Université de Rennes 1
Budget
2 500 K€
Cofinanceurs publics
FUI et Collectivités territoriales
Année de labellisation
2008 - Colabellisé avec le Pôle Optitec et le Pôle Eau
Année de cofinancement
2011